Este Hospital es parte de la Infraestructura de Salud perteneciente al sistema de Salud publico ecuatoriano. El actual hospital fue proyectado a partir de la fusión del Hospital San Juan de Dios y el Sanatorio de la Liga Ecuatoriana Antituberculosa en 1973, pasando a ser una unidad operativa del Ministerio de Salud Pública del Ecuador. Es uno de los hospitales provinciales de referencia en el país y la capital.

En el año 2007 y por decreto ejecutivo se declararon en estado de emergencia a varios hospitales que necesitaban de una intervención urgente. Es así, como nace este proyecto a partir de un PLAN DE CONTINGENCIA planificado en Tres Etapas las cuales permitirían construir un Moderno Hospital. El proyecto fue diseñado de manera que la operación y funcionamiento del actual Hospital no se vea interrumpida en ningún momento. 

Los estudios integrales de las tres etapas se encuentran concluidos, Dentro de la primera etapa de este proyecto, se construyó el bloque de EMERGENCIA y CONSULTA EXTERNA en un edificio de 3 plantas más un subsuelo de estacionamientos que luego se vincularía física y funcionalmente con el resto del proyecto y sus diferentes etapas.. Se espera que próximamente se continúe el proyecto con la actualización de los estudios y la construcción de las ETAPAS DOS Y TRES.

La etapa 2 del proyecto comprende la mayoría de los servicios del Hospital y la planificación permite que esta etapa sea construida mientras el mismo no deje de funcionar. En este bloque se encuentran servicios como: laboratorio, diagnóstico por imágenes, centro quirúrgico, cuidados intensivos, unidad de quemados, esterilización, hospital del día, hospitalización, entre otros.

En etapa 3 se unifica el proyecto total con el derrocamiento del edificio antiguo y se construiría el vestíbulo de ingreso y los servicios de rehabilitación física, diálisis, servicios administrativos, docencia y farmacia. Además, de contar con varios subsuelos de estacionamientos en las 3 etapas.